Евангелическо-лютеранская церковь России (ЕЛЦР) состоит из двух региональных церквей (диоцезов):
Евангелическо-лютеранская церковь Европейской части России (ЕЛЦ ЕР),
Евангелическо-лютеранская церковь Урала, Сибири и Дальнего Востока (ЕЛЦ УСДВ).
Духовным руководителем является архиепископ Евангелическо-лютеранской церкви России (до 1999 года — епископ), избираемый на Генеральном синоде бессрочно.
С 2014 — архиепископ Дитрих Брауэр.